该剧讲述以宋慈为首的六位少年因机缘巧合相聚在一起，携手破获多起神秘诡谲的疑案，意外卷入南宋朝堂主战派和主和派斗争，逐渐从懵懂的少年成长为真正心怀家国大义之人的故事。

大宋淳祐七年，钦州灵龙镇灾患频现，民间谣言乃蛟龙作祟，需将童男童女投入锁龙井喂食蛟龙方能得享安宁，家有幼童者皆人心惶惶。一日，新科进士庄严途径此地，闻听此事坚持将童男童女救下，却不想竟意外卷进一宗离奇杀人案而锒铛入狱。灵龙县仵作助手小宛为救心上人，不远千里求请已金盆洗手的宋慈出山查明真相。案件疑点重重，宋慈和小宛联手，突破重重难关，终于真相水落石出。然而眼看灵龙镇逐渐恢复平静，宋慈却发现原来真相并没有他想象中那么简单……