《巴山女红军》主要讲述中国工农红军第红四方面军妇女独立团在川陕革命根据地的那一段辉煌历程，是对当年三千多名年轻的女红军战士人生亲情与爱情、成长与苦恼、理想与冲突的多视角的展示。红四方面军在川北创建了苏维埃政权，以苦妹子、小莲为首的一大批童养媳纷纷报名参加了红军，积极参加打土豪分田地的斗争。苦妹子在一次战斗中英勇牺牲，小莲随妇女独立团配合红四方面军主力北上……

讲述了杨柳村有着世代宿怨的李杜两家，因为李海龙和杜小莲的婚姻，两家人的矛盾也开始化解了，不料在矛盾化解的时候，李海龙却遭到了别人的陷害被捕入狱，虽然经过杜小莲的四处奔走，还了李海龙的清白，但李海龙却负气离家出走。大学生村主任童兴明带领村民靠发展渔业致富，但他却并不满足，又带领村民走上多种经营的道路，而他爱慕的同学林檬，见他一心扎根农村，便悄然离去，这使童兴明心里有些失落。在他带领村民学习花卉栽培技术时，偶然认识了种花专业户陶莉，两人从误解到相知慢慢产生了情愫。