于战乱中遗失的北京猿人头盖骨化石的下落，已成为半个世纪以来萦绕在中国和世界人类学界和考古学界的最大谜团。及至今日，中国人民和世界上有良知的科学家们，仍在苦苦寻觅“北京人”的下落。《远去的“北京人”》以抗日战争期间，“北京人”失踪前后为背景，讲述了几个怀着不同的政治见解和隐秘使命的年轻人，始终关注着战乱中“北京人”化石的研究、保护和迁移状况以及相互间产生的情感纠葛、利益冲突和命运抗争。

为了调查案情，技术科警察苏见明（雷佳音 饰）不顾父亲郑刚（张国立 饰）的劝阻，赶赴富商黎志田（于和伟 饰）的“鸿门宴”，观看了一出黎志田愚弄他人、手入火锅的猖狂戏码。随后，墙缝藏尸、扳手砸人、近一百个亿的私相授受和神秘的“老爷子的资源”等伏笔相继扯出，表面单纯的犯罪事件背后暗流涌动。